A poco más de medio año de las elecciones intermedias de México, Morena enfrenta una serie de controversias que involucran a figuras cercanas al expresidente Andrés Manuel López Obrador y al Instituto Nacional Electoral. Entre los asuntos que han generado mayor atención se encuentran los señalamientos contra Andrés Manuel López Beltrán y la reciente renuncia de Guadalupe Taddei a la presidencia del INE.
López Beltrán difundió un video en el que denunció una presunta campaña de desinformación y calumnias en su contra, después de que partidos de oposición lo señalaran por supuestos vínculos con el contrabando de combustibles. El morenista, quien fue secretario de Organización del partido y dejó el cargo en mayo para buscar la gubernatura de Tabasco en 2027, reconoció que su nombre apareció en la investigación, pero negó cualquier participación delictiva. La controversia también aumentó luego de que se conociera que Estados Unidos le retiró la visa.
Por su parte, la presidenta Claudia Sheinbaum ha rechazado que estos señalamientos comprometan el proceso electoral de 2027 y ha sostenido que cualquier indicio de delito debe investigarse. Las controversias se producen mientras Morena busca mantener su fuerza política en las 17 gubernaturas que estarán en disputa y en el Congreso de la Unión, por lo que los casos representan un desafío para la imagen del movimiento rumbo a los próximos comicios.